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使用 BIOVIA Living Map 重新利用安全药物

抗击 COVID-19 的新方向

药物再利用和系统生物学可以帮助确定已知对治疗 SARS-CoV-2 病毒安全有效的药物。幸运的是,这些双胞胎方法也可以为未来病原性冠状病毒的治疗指明方向。

重新利用安全药物 在全球大流行中

药物再利用涉及为新的治疗目的研究现有的、经过临床测试的和安全的药物。

科学家们正在使用基于结构的和虚拟筛选,以根据他们的in silico选择现有药物 倾向于靶向病毒蛋白酶并可能减少病毒增殖。请参阅药效团引导的药物再利用虚拟筛选抑制 SARS-CoV-2 主要蛋白酶 然而,没有一种已知的药物真正脱颖而出。因此,我们需要考虑其他策略。

系统生物学侧重于生物系统内复杂相互作用的计算分析和建模。此外,这种方法利用了从许多 COVID-19 计划中在全球范围内积累的大量数据和知识。

用活地图导航系统生物学

BIOVIA Living Map 是 Dassault Systèmes 3D 上的一项服务 体验 ® 平台。它为系统生物学提供了强大的建模和仿真功能。重要的是,它还可以自动访问学术数据资源和知识。

Living Map 允许生物学家设计和模拟布尔生物网络。此外,该应用程序经过科学验证的布尔信号通路使科学家能够构建定性疾病图,计算机 实验并检验新假设。

最重要的是,科学家可以使用指向参考数据库的证据支持链接来注释 Living Map 模型。他们可以注释实体、交互和建模的原因。重要的是,这些关键的证据注释不断提高 BIOVIA Living Map 的置信度。

模拟 SARS-CoV-2 对先天免疫的影响

BIOVIA 科学家正在使用 Living Map 研究药物在抗击 SARS-CoV-2 中的再利用。

在一个项目中,我们通过组装 COVID-19 之前发布的通用冠状病毒细胞信号通路构建了一个动态模型。接下来,我们使用更具体和最新的 SARS-CoV-2 知识来定制和验证我们的模型。最后,我们启动了模拟以研究重新利用的候选药物并提出新的治疗干预措施。随后,Living Map 并没有预测一种批准的药物可以逆转冠状病毒。然而,该应用确实确定了一种可能有效的病毒-宿主蛋白相互作用。

模拟非冠状病毒感染与 SARS-CoV-2

这个视频 展示了我们如何模拟和测试经典的非冠状病毒感染。当我们模拟经典感染时,我们发现宿主的先天免疫反应成功地抑制了感染的复制/传播。

然而,当我们测试 SARS-CoV-2 病毒时,我们发现冠状病毒抑制了宿主的先天免疫反应。随后,这使得冠状病毒能够成功复制和繁殖。与临床观察一致,SARS-CoV-2 病毒增加了促炎细胞因子的产生。这导致了细胞因子风暴,身体在其中攻击自己的细胞和组织,而不是与病毒作斗争。

推进创新目标发现

在 BIOVIA Living Map 的指导下,您可以在 3D 上协作、理解和注释疾病机制、药物作用方式和治疗耐药性 体验 ® 平台。您可以构建和使用模型来通过模拟来研究研发假设。此外,您可以推进创新目标发现,同时还可以挑选出最有前景的治疗方案。

BIOVIA Living Map 有助于将科学调查时间缩短数周。此外,它还可以降低湿实验室验证成本并增加成功发现的可能性。

当然,当您踏上探索之旅时,您需要一张好的地图来指导您。

使用 BIOVIA Living Map 重新利用安全药物!


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