解码SARS-CoV-2基因组：COVID-19的DNA与抗体检测
“检测、检测、检测！”已成为COVID-19遏制的呐喊。全球卫生权威——包括世卫组织和国家机构——持续强调快速大规模检测是任何有效大流行响应的关键。
广泛诊断覆盖通过揭示谁被感染、病毒在哪里传播，为针对性公卫措施提供信息——如社交距离、居家令、必要时宵禁——减轻医疗系统压力、最终挽救生命。
基于基因组的分析是任何SARS-CoV-2检测的基石，无论是基于DNA的检测（RT-PCR、等温扩增、CRISPR）还是使用病毒抗原的血清学检测。全球非营利联盟编目了所有商业可用检测；这里聚焦当今使用的两种主要模式：核酸检测和抗体筛查。
基于DNA的检测
当前临床方案依赖从鼻咽或口咽拭子提取病毒RNA、扩增SARS-CoV-2基因组独特片段。金标准是逆转录聚合酶链反应（RT-PCR），Abbott Laboratories等温平台提供快速替代。
RT-PCR分三阶段：(1) RNA提取；(2) 逆转录成cDNA；(3) 温度循环PCR变性、退火引物、延伸产物，产生指数级扩增。结果通常几小时内出。世卫组织和CDC提供详细方案。
相比之下，Abbott等温分析消除热循环需求。5分钟出阳性、13分钟出阴性1。
靶点选择依赖全基因组比较锁定SARS-CoV-2独有区域。病毒约3万碱基单链RNA编码四结构蛋白——包膜(E)、膜(M)、核衣壳(N)、刺突(S)。比较分析在ORF1ab、N、RdRp、S识别独特序列作为引物探针模板。当前RT-PCR试剂盒靶向这些区域2，Abbott ID NOW™ COVID-19分析聚焦RdRp。
新兴技术
基于CRISPR的诊断——利用酶序列特异性切割——提供可扩展检测替代。SHERLOCK平台（特异性高灵敏酶报告解锁）结合CRISPR-Cas13与侧向层析读出，~1小时出结果。DETECTR，CRISPR-Cas12分析，30分钟出结果34。
序列导向检测提供病毒存在的确凿证据，是知情公卫决策前提。美国检测传统聚焦有症状者，但无症状传播仍是重大风险，凸显广泛诊断覆盖必要性。
基于抗体的检测
血清学分析检测响应SARS-CoV-2产生的抗体，识别既往感染者并可能具保护性免疫。这些检测也助于筛选恢复期血浆捐赠者用于治疗——美国正研究此策略。
成功抗体诊断取决于选择引发强烈免疫反应的病毒抗原。刺突(S)蛋白，特别是其受体结合域(RBD)，是主要靶点，因其高免疫原性。其他候选含核衣壳(N)蛋白和全长刺突构建。抗原在重组系统生产，随后整合入酶联免疫吸附分析(ELISA)或快速侧向层析格式。
开发可靠家用检测盒仍具挑战，主要因需正确蛋白折叠和翻译后修饰。美国FDA近期批准首个抗体检测，为估算群体免疫提供框架5。
当前大流行格局下，基于DNA和抗体的诊断对塑造旨在遏制SARS-CoV-2传播的公卫干预至关重要。快速准确检测在我们持续“压平曲线”中仍不可或缺。
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