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SOX2调控CCAT1/miR-185-3p/FOXP3通路控制宫颈癌干细胞增殖与自我更新

摘要

已有研究阐述长链非编码RNA(lncRNAs)在宫颈癌(CC)中的作用。本研究旨在探讨性别决定区Y框蛋白2(SOX2)/结肠癌相关转录本1(CCAT1)/微小RNA-185-3p(miR-185-3p)/叉头框蛋白3(FOXP3)轴对宫颈癌干细胞增殖和自我更新能力的影响。检测CC组织和细胞中miR-185-3p、SOX2、CCAT1、FOXP3表达。验证SOX2/CCAT1表达与CC患者临床病理特征关系。在CD44+HeLa细胞中进行失/得功能实验探讨生物学功能和自我更新能力。最终验证SOX2、CCAT1、FOXP3、miR-185-3p间关系。CC组织和细胞中miR-185-3p表达降低,SOX2、CCAT1、FOXP3表达升高。SOX2和CCAT1表达与CC肿瘤大小、淋巴结转移(LNM)和国际妇产科联盟分期(FIGO分期)相关。下调SOX2或CCAT1、上调miR-185-3p抑制CD44+HeLa细胞增殖、侵袭、迁移、成球数并促进凋亡。SOX2可结合CCAT1影响miR-185-3p表达,FOXP3被miR-185-3p靶向。

引言

宫颈癌(CC)是女性第四大死因,2018年全球估计57万新增病例、31.1万死亡。这种复杂疾病涉及遗传效应、病毒感染等多种因素。随着HPV联合检测和HPV疫苗推广,宫颈上皮内瘤变和癌症早期诊断降低了CC发病率、发病率和死亡率。早期CC患者推荐手术:保留生育功能手术、锥切、广泛气管切除、盆腔淋巴结清扫、盆腔放疗、近距离放疗。因晚期CC患者转移复发,预后仍差。因此仍迫切需要鉴定新有效预后标志物和治疗策略改善CC治疗。

性别决定区Y框蛋白2(SOX2)是SOX家族转录因子关键成员,主要表达于胚胎和成体干细胞,也在肿瘤干细胞表达。研究显示SOX2通过刺猬信号通路调控CC放射抵抗。另一研究证实SOX2对维持CC细胞系癌干细胞亚群至关重要。长链非编码RNA(lncRNAs)是长度≥200核苷酸RNA分子。结肠癌相关转录本1(CCAT1)位于人类8q24.21染色体,被视为结肠癌遗传突变"热点"。研究报道CCAT1加速CC细胞增殖侵袭。Jia等报道CCAT1显著增强CC细胞增殖、迁移、侵袭。另一研究揭示CCAT1通过降低微小RNA-185-3p(miR-185-3p)破坏肠道屏障加重炎症性肠病恶性程度。miRNA可通过降低mRNA、抑制翻译反向调控基因表达。体外实验显示miR-185-3p调控鼻咽癌放射抵抗。另一研究暗示miR-185参与卵巢癌顺铂耐药。叉头框蛋白3(FOXP3)属FOX蛋白家族转录因子,首见于调节性T(Treg)细胞,在Treg细胞维持和过程中起关键作用。研究报道FOXP3与CC淋巴管生成相关。另一研究揭示FOXP3水平与CC FIGO分期和肿瘤大小显著相关。本研究因此考察SOX2/CCAT1/miR-185-3p/FOXP3轴对CC干细胞增殖和自我更新能力影响。

材料与方法

伦理批准与知情同意

涉及人类实验遵循赫尔辛基宣言原则。经吉林大学第一医院机构审查委员会批准。所有参与者签署知情同意书。

研究对象

2016年12月至2018年12月从CC患者获取39例CC组织及对应邻近正常组织,液氮保存。纳入标准:(1)病理活检、宫颈涂片细胞学、碘实验、阴道窥器、宫颈椎切除确诊CC;(2)术前2周未接受放化疗。排除标准:(1)接受任何放化疗;(2)不同意样本采集;(3)免疫系统疾患。

细胞筛选与培养

CC细胞系(SiHa、HeLa、CaSki、HCC94、C33A)和人宫颈上皮永生化细胞系H8购自上海伯乐生物科技有限公司。SiHa、HeLa、HCC94用高糖DMEM含10% FBS培养;CaSki、C33A、H8用RPMI-1640含10% FBS培养(37℃、5% CO2)。每2天消化传代。

CC干细胞分选(CD44+HeLa细胞)

CC干细胞从HeLa细胞系通过悬浮培养分离。HeLa细胞用无血清Iscove改良Dulbecco培养基(IMDM)在超低吸附培养皿培养21天,每3-5天半定量换液。部分细胞悬浮成球,获HeLa成球细胞(SFCs)。鉴定分析球形细胞特性。胰蛋白酶消化调整至1×106细胞/mL。加CD44抗体流式细胞术分选。CD44阳性HeLa为肿瘤干细胞,阴性为非干细胞。CC干细胞用DMEM/F12培养,添加20 ng/mL基本成纤维细胞生长因子(bFGF)、20 ng/mL表皮生长因子(EGF)和B27,含1%青霉素链霉素。

细胞处理

CD44+HeLa细胞转染sh-SOX2、sh-SOX2 NC、sh-CCAT1、sh-CCAT1 NC、miR-185-3p mimic、mimic NC、sh-CCAT1+miR-185-3p inhibitor、sh-CCAT1+inhibitor NC。所有寡核苷酸序列由GenePharma(上海中国)提供。胰蛋白酶消化后接种6孔板(3×106细胞/孔)。达60%融合度时换无血清培养基孵育1小时。用Lipofectamine 2000(Invitrogen,美国)转染。

逆转录定量聚合酶链反应(RT-qPCR)

组织细胞RNA用Trizol(Invitrogen)提取。1 μg RNA用莫洛尼鼠白血病病毒逆转录酶试剂盒(Invitrogen)逆转录cDNA。cDNA加入实时PCR体系。引物由上海桑根生物工程有限公司设计(表1)。U6为miR-185-3p内参,甘油醛-3-磷酸脱氢酶(GAPDH)为SOX2、CCAT1、FOXP3内参。2−ΔΔCt法分析结果。

Western Blot实验

提取细胞组织总蛋白。双氯乙酸试剂盒(AmyJet Scientific,武汉中国)测定蛋白浓度。蛋白加样品缓冲液煮沸5分钟,冰浴离心。10% SDS-PAGE电泳转膜。5%脱脂奶粉封闭1小时,一抗SOX2(1:1000,江苏瑞思坦生物科技)、FOXP3(1:1000,Abcam,美国)、GAPDH(1:1000,Cell Signaling Technology,美国)孵育,再加辣根过氧化物酶标记二抗,封口膜覆盖曝光。Bio-rad Gel Doc EZ成像仪(Bio-rad,美国)显影。ImageJ2x软件分析蛋白图像。

细胞计数试剂盒(CCK-8)实验

用CCK-8试剂盒(Beyotime,上海中国)实验。细胞(1×104)接种96孔板培养。培养0、24、48、72小时后每孔加10 μL CCK-8溶液孵育1小时。全波长酶标仪(Multiskan Spectrum)450 nm测定光密度值。取6孔平均值。以时间为横坐标、相对细胞活力为纵坐标绘制生长曲线。光密度值代表细胞增殖。

流式细胞术

细胞(1×106)1500 r/min离心,200 μL结合缓冲液重悬,依次加5 μL碘化丙啶(PI)、5 μL Annexin V-FITC,加400 μL缓冲液。流式细胞仪(BD Biosciences,美国)验证细胞凋亡率。

划痕实验

转染细胞消化制成细胞悬液。细胞悬液(1×106细胞/mL)接种6孔板培养至80-90%融合。用10 μL无菌吸头沿刻度尺在6孔板均匀划横向和纵向划痕。换完全培养基持续培养。0小时和72小时显微镜观察细胞迁移并同位置拍照。

Transwell实验

转染细胞胰蛋白酶消化、1000 g离心、DMEM洗涤。完全水合Transwell小室置于含10% FBS-DMEM(600 mL/孔)24孔板。细胞悬液(5×105细胞/mL,200 μL)加入上室(包被1:8 Matrigel 80 μL),下室加500 μL 20% FBS-DMEM。持续培养24小时,500 μL 4%多聚甲醛(PFA)固定,0.1%结晶紫染色。棉签擦去上室表面和边缘细胞。随机选5视野,倒置显微镜(Nikon Eclipse TE2000-S,日本)计数。

成球实验

低吸附6孔板含无血清悬浮培养基,每孔接种200细胞。2周后倒置显微镜(Nikon Eclipse TE2000-S)观察成球率,成球率=平均球数/接种细胞数×100%。

染色质免疫沉淀(ChIP)实验

ChIP实验用ChIP试剂盒(Upstate,美国)。SOX2(1:1000,Re-stem Biotech,江苏中国)和正常兔IgG(12-370,Millipore,美国)抗体免疫沉淀交联蛋白-DNA复合物。CD44+HeLa细胞1% PFA固定孵育产生DNA-蛋白交联。超声将DNA打断成200-300 bp染色质片段。回收沉淀染色质DNA经RT-qPCR分析。

RNA Pull-Down实验

生物素标记miR-185-3p野生型(WT)和突变型(MUT)质粒(50 nM)分别转染CD44+HeLa细胞。转染48小时后特定细胞裂解液(Ambion,美国)裂解细胞。细胞裂解液(50 mL)分装。残余裂解液与预包被RNase-free和酵母tRNA(Sigma)的M-280链霉亲和素磁珠(Sigma,美国)孵育。随后冷裂解液洗涤两次、低盐缓冲液三次、高盐缓冲液一次。拮抗miR-185-3p探针作阴性对照。Trizol提取总RNA,RT-qPCR检测CCAT1水平。

双荧光素酶报告基因实验

利用https://jaspar.genereg.net/预测分析SOX2在CCAT1启动子区潜在结合位点E1、E2。合成含SOX2和CCAT1结合位点E1的CCAT1启动子序列,构建CCAT1 3'UTR WT(E1-WT)和CCAT1 3'UTR MUT(E1-MUT)载体。克隆入pmirGLO(Beyotime)。CCAT1-WT/pmirGLO或CCAT1-MUT/pmirGLO分别与sh-SOX2或sh-SOX2 NC共转染CD44+HeLa细胞2天裂解。荧光素酶检测系统(Takara,大连中国)测定荧光素酶活性。

生物信息学网站预测分析CCAT1和miR-185-3p结合位点。双荧光素酶报告基因实验验证CCAT1和miR-185-3p结合位点。构建含miR-185-3p结合位点CCAT1 3'UTR WT和MUT,与mimic NC和miR-185-3p mimics共转染CD44+HeLa细胞2天,裂解细胞,荧光素酶检测系统测定活性。相同方法验证miR-185-3p与FOXP3靶向关系。

统计分析

所有数据用SPSS 21.0(IBM,美国)评估。测量数据均值±标准差表示。两组差异用t检验,多组用单因素ANOVA后Tukey多重比较。分类变量用Fisher精确检验。P<0.05视为显著。

结果

CC组织中miR-185-3p表达降低,SOX2、CCAT1、FOXP3表达升高,SOX2和CCAT1表达与肿瘤大小、LNM、FIGO分期相关

检测SOX2/CCAT1/miR-185-3p/FOXP3轴对CC干细胞增殖自我更新影响时,用RT-qPCR和Western blot检测CC组织和邻近正常组织中miR-185-3p、SOX2、CCAT1、FOXP3表达。结果显示(图1a-c)CC组织中miR-185-3p表达降低,SOX2、CCAT1、FOXP3表达升高。

SOX2调控CCAT1/miR-185-3p/FOXP3通路控制宫颈癌干细胞增殖与自我更新
CC组织中miR-185-3p表达降低,SOX2、CCAT1、FOXP3表达升高。a CC和邻近正常组织SOX2 mRNA、CCAT1、miR-185-3p、FOXP3 mRNA表达比较。b CC和邻近正常组织SOX2和FOXP3蛋白条带。c SOX2和FOXP3蛋白表达比较。*p<0.05 vs 邻近正常组织。测量数据均值±标准差,两组t检验

分析SOX2/CCAT1表达与CC临床病理特征关系(表2)。CC中SOX2和CCAT1过表达与肿瘤大小、LNM、FIGO分期相关,提示肿瘤较大、有LNM、FIGO分期晚期CC患者SOX2和CCAT1表达更高。

CD44+HeLa细胞中miR-185-3p表达降低,SOX2、CCAT1、FOXP3表达升高

接着检测人宫颈上皮永生化细胞H8和CC细胞系SiHa、CaSki、HeLa、HCC94、C33A中miR-185-3p、SOX2、CCAT1、FOXP3表达。结果提示(图2a-c)CC细胞系中miR-185-3p表达降低,SOX2、CCAT1、FOXP3升高。其中HeLa细胞SOX2/CCAT1/miR-185-3p/FOXP3与H8细胞表达差异最大;筛选HeLa细胞分选,悬浮培养获HeLa-SFCs,流式细胞术鉴定分选前后细胞表面CD44表达。结果显示HeLa-SFCs中CD44阳性率显著高于分选前,提示CC干细胞分选成功(图2d)。分选干细胞命名为CD44+HeLa细胞。检测HeLa和CD44+HeLa细胞中miR-185-3p、SOX2、CCAT1、FOXP3表达(图2e-g)。结果显示CD44+HeLa细胞中SOX2、CCAT1、FOXP3表达上调,miR-185-3p下调。

SOX2调控CCAT1/miR-185-3p/FOXP3通路控制宫颈癌干细胞增殖与自我更新
CD44+HeLa细胞中miR-185-3p表达降低,SOX2、CCAT1、FOXP3表达升高。a H8和CC细胞系SOX2 mRNA、CCAT1、miR-185-3p、FOXP3 mRNA表达比较。b H8和CC细胞系SOX2和FOXP3蛋白条带。c H8和CC细胞系SOX2和FOXP3蛋白表达比较。d 分选前后HeLa细胞CD44表达率流式细胞术检测。e HeLa和CD44+HeLa细胞SOX2 mRNA、CCAT1、miR-185-3p表达比较。f HeLa和CD44+HeLa细胞SOX2蛋白条带。g HeLa和CD44+HeLa细胞SOX2蛋白表达比较。^p<0.05 vs H8细胞。&p<0.05 vs HeLa细胞。测量数据均值±标准差,两组t检验,多组单因素ANOVA后Tukey事后检验

下调SOX2和下调CCAT1抑制CD44+HeLa细胞增殖、迁移、侵袭、成球率并促进凋亡

随后在CD44+HeLa细胞中沉默SOX2和CCAT1探索其对CC干细胞增殖自我更新影响。CCK-8、流式细胞术、划痕、Transwell、成球实验检测显示(图3a-i),抑制SOX2和CCAT1抑制增殖、迁移、侵袭、成球率,促进凋亡。提示沉默SOX2或CCAT1抑制CC干细胞增殖和自我更新。

SOX2调控CCAT1/miR-185-3p/FOXP3通路控制宫颈癌干细胞增殖与自我更新
下调SOX2和下调CCAT1抑制增殖、迁移、侵袭、成球率并促进凋亡。a CCK-8检测sh-CCAT1或sh-SOX2处理细胞生长曲线。b 流式细胞术检测sh-CCAT1或sh-SOX2处理细胞凋亡。c 细胞凋亡率比较。d 划痕实验检测细胞迁移。e 细胞迁移比较。f Transwell检测侵袭能力。g 侵袭能力比较。h 成球实验检测自我更新能力。i 成球率比较。a p<0.05 vs sh-SOX2 NC组。b p<0.05 vs sh-CCAT1 NC组。测量数据均值±标准差,多组单因素ANOVA后Tukey事后检验

耗竭miR-185-3p逆转CCAT1下调在CD44+HeLa细胞中的作用

进而考察miR-185-3p是否参与CCAT1调控CC干细胞增殖自我更新过程。CD44+HeLa转染miR-185-3p mimic或共转染sh-CCAT1和miR-185-3p inhibitor。结果显示(图4a-i),上调miR-185-3p显著降低增殖、迁移、侵袭、成球率、提高凋亡率。miR-185-3p inhibitor可逆转CCAT1下调对CD44+HeLa细胞增殖、迁移、侵袭、凋亡、成球形成作用。

SOX2调控CCAT1/miR-185-3p/FOXP3通路控制宫颈癌干细胞增殖与自我更新
过表达miR-185-3p抑制增殖、迁移、侵袭、成球率并增加凋亡。a CCK-8检测miR-185-3p mimic处理细胞生长曲线。b 流式细胞术检测miR-185-3p mimic处理细胞凋亡。c 细胞凋亡率比较。d 划痕实验检测细胞迁移。e 细胞迁移比较。f Transwell检测侵袭能力。g 侵袭能力比较。h 成球实验检测自我更新能力。i 成球率比较。a p<0.05 vs sh-SOX2 NC组。b p<0.05 vs sh-CCAT1 NC组。c p<0.05 vs mimic NC组。d p<0.05 vs sh-CCAT1+inhibitor NC组。测量数据均值±标准差,多组单因素ANOVA后Tukey事后检验

低表达SOX2和低表达CCAT1降低CD44+HeLa细胞FOXP3表达、升高miR-185-3p表达

随后检测转染sh-SOX2、sh-CCAT1、miR-185-3p mimic及sh-CCAT1+miR-185-3p inhibitor共转染后CD44+HeLa细胞SOX2/CCAT1/miR-185-3p/FOXP3表达。sh-SOX2处理细胞SOX2、CCAT1、FOXP3表达降低,miR-185-3p升高。sh-CCAT1处理细胞CCAT1、FOXP3降低,miR-185-3p升高。miR-185-3p mimic处理细胞miR-185-3p升高、FOXP3降低。sh-CCAT1+miR-185-3p inhibitor连续转染细胞FOXP3升高、miR-185-3p降低(图5a-d)。

SOX2调控CCAT1/miR-185-3p/FOXP3通路控制宫颈癌干细胞增殖与自我更新
低表达SOX2和低表达CCAT1降低FOXP3表达、升高miR-185-3p表达。a sh-SOX2 NC和sh-SOX2组SOX2/CCAT1/miR-185-3p/FOXP3表达。b sh-CCAT1 NC和sh-CCAT1组表达。c mimic NC和miR-185-3p mimic组表达。d sh-CCAT1+inhibitor NC和sh-CCAT1+miR-185-3p inhibitor组表达。a p<0.05 vs sh-SOX2 NC组。b p<0.05 vs sh-CCAT1 NC组。c p<0.05 vs mimic NC组。d p<0.05 vs sh-CCAT1+inhibitor NC组。测量数据均值±标准差,多组单因素ANOVA后Tukey事后检验

SOX2结合CCAT1影响miR-185-3p表达,FOXP3是miR-185-3p靶基因

利用https://jaspar.genereg.net/预测分析CCAT1启动子区转录因子潜在结合位点,显示SOX2和CCAT1在CCAT1启动子区有潜在结合位点(图6a)。ChIP-qPCR显示(图6b):与IgG组相比,SOX2组在E1结合位点富集更多CCAT1启动子片段,证实SOX2结合CCAT1启动子E1位点,参与CCAT1调控。双荧光素酶报告基因实验显示(图6c):共转染sh-SOX2和E1-WT细胞荧光素酶活性受抑,表明SOX2可结合CCAT1。

SOX2调控CCAT1/miR-185-3p/FOXP3通路控制宫颈癌干细胞增殖与自我更新
SOX2可结合CCAT1影响miR-185-3p表达,FOXP3是miR-185-3p靶基因。a 生物信息学预测SOX2和CCAT1启动子区结合位点。b ChIP-qPCR验证SOX2和CCAT1结合关系。c 双荧光素酶报告基因实验验证SOX2和CCAT1结合位点。d 生物信息学预测CCAT1和miR-185-3p结合位点。e 双荧光素酶报告基因实验验证CCAT1和miR-185-3p结合。f RNA pull-down实验验证细胞中CCAT1和miR-185-3p结合关系。g 生物信息学预测miR-185-3p和FOXP3靶向关系。h 双荧光素酶报告基因实验鉴定miR-185-3p靶向FOXP3。测量数据均值±标准差,两组t检验

Jefferson网站预测CCAT1可结合miR-185-3p(图6d)。双荧光素酶报告基因实验显示(图6e):导入miR-185-3p mimic和CCAT1-WT细胞荧光素酶活性降低,提示miR-185-3p可结合CCAT1。RNA pull-down实验验证CCAT1是否结合miR-185-3p。结果显示(图6f):Bio-miR-185-3p-WT处理细胞CCAT1富集水平显著升高,Bio-miR-185-3p-MUT处理细胞CCAT1富集无显著差异。证明CCAT1可吸附miR-185-3p,从而影响miR-185-3p表达。

Jefferson网站预测miR-185-3p与FOXP3靶向关系(图6g)。双荧光素酶报告基因实验验证(图6h):FOXP3-WT与miR-185-3p mimic共转染CD44+HeLa细胞相对荧光素酶活性显著降低,FOXP3-MUT共转染miR-185-3p mimic不影响活性,提示miR-185-3p靶向FOXP3。

讨论

CC是全球女性第四高发恶性肿瘤,仅次于乳腺癌、结肠癌、肺癌。报道SOX2阳性表达CC细胞表现癌干细胞特征。研究报道CCAT1是CC相关关键致癌lncRNA,促进CC细胞生长侵袭。另一研究揭示miR-185-3p可预测鼻咽癌放射敏感性、调控癌细胞生长凋亡。报道循环抗FOXP3自身抗体反映宫颈病变持续进展,可能是CC早期预后潜在生物标志物。本研究旨在探索SOX2/CCAT1/miR-185-3p/FOXP3轴如何影响CC干细胞增殖自我更新能力。

基于研究发现,SOX2和CCAT1在CC组织细胞中高表达,与肿瘤大小、LNM、晚期FIGO相关。功能验证下调SOX2和CCAT1抑制CC干细胞增殖、迁移、侵袭、成球数、促进凋亡。类似本研究,SOX2表达趋于在CC升高。SOX2在源自癌干细胞CC细胞中也上调。过表达SOX2建议与多种癌症患者临床病理特征相关,不限于CC。如SOX2上调见于FIGO I-II期宫颈鳞癌患者。SOX2表达与口腔鳞癌LNM相关。关于SOX2癌症进展分子功能,观察性工作显示下调SOX-2抑制宫颈鳞癌细胞迁移侵袭。另一研究证实上调SOX2增强CC细胞克隆形成、增殖、成瘤性(体内外优于对照)。

关于SOX2和CCAT1调控关系,现有研究显示沉默SOX2显著降低CCAT1 mRNA水平。关于CCAT1癌症作用,研究显示CCAT1在CC组织中显著高表达于邻近正常组织。值得注意的是CCAT1过表达与CC肿瘤大小正相关。关于CCAT1癌细胞活性作用,研究强调过表达CCAT1加速CC细胞增殖、克隆形成、侵袭。有趣的是前人研究证实敲低CCAT1降低细胞活力、侵袭迁移能力。总之SOX2和CCAT1在其他癌症功能效应与CC相似。

随后研究揭示CCAT1可结合miR-185-3p,下调CCAT1和过表达miR-185-3p抑制CC干细胞增殖自我更新能力。报道CCAT1和miR-185-3p负相关。此外报道放射抵抗鼻咽癌病例miR-185-3p表达降低。关于miR-185-3p抑制癌细胞侵袭性功能,研究显示上调miR-185-3p抑制鼻咽癌细胞侵袭转移特性。Zou等建议恢复miR-185抑制乳腺癌细胞生长侵袭。有文章发现上调miR-185降低非小细胞肺癌细胞体外增殖、侵袭、克隆形成能力。体外增殖、侵袭、迁移及体内肿瘤生长被miR-185过表达抑制于非小细胞肺癌细胞。这些研究中miR-185-3p抗肿瘤角色与本研究一致。

进而揭示miR-185-3p靶向FOXP3,FOXP3作为CC过表达基因调控CC干细胞活性。事实上FOXP3作为结肠癌SOX2癌干细胞标志物调节因子,在CC中被研究显示上调。证实上调FOXP3促进肿瘤球形成、刺激非小细胞肺癌细胞干性。

结论

综上,我们首次探明SOX2转录激活CCAT1,从而抑制miR-185-3p调控FOXP3促进CC干细胞增殖自我更新,为CC治疗提供潜在途径。但本研究仍存在实验样本量相对较小局限,未来可开展临床研究进一步验证治疗CC疗效。

数据与材料可用性

不适用。

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